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南太平洋1000尺的深海海底,美国政府发现了一艘已有300年历史的神秘太空船。当局立刻组成了一队由心理学家诺曼·古德曼(达斯汀·霍夫曼 Dustin Hoffman饰)、生物化学家贝丝·哈波琳(莎朗·斯通 Sharon Stone饰)和数学家哈瑞·亚当斯(塞缪尔·杰克逊 Samuel L. Jackson饰)这三位顶尖科学家组成的科学小组前往当地调查。他们利用高科技的实验艇深入海底进行探测。然而船体内部的一个巨大而怪异的球状体,拥有着洞悉每个人的内心世界的强大魔力,它似乎能控制每个人的思想和行为。更糟的是,一个不明海底生物也向实验艇发起了攻击。